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植物细胞器基因组变异与进化机制研究

植物细胞器基因组变异与进化机制研究

摘要第7-9页ABSTRACT第9-11页第一章绪论第15-32页植物细胞器基因组及其变异第15-28页植物细胞中的半自主性细胞器第15页叶绿体和线粒体的生理功能第15-16页叶绿体和线粒体的起源与进化过程第16-21页细胞器基因组的发现与研究现状第21-23页叶绿体基因组和线粒体基因组的结构特征与变异规律第23-28页基因组大数据的快速产生及其应用第28-29页基于细胞器基因组变异的环境生物学大数据分析展望第29-32页第二章植物叶绿体基因组变异模式的解析及机制探讨第32-83页引言第32页研究背景第32-36页材料方法第36-45页材料采集第36-38页叶绿体DNA提取第38页叶绿体基因组测序第38-39页叶绿体基因组组装第39-40页叶绿体基因组注释第40页全基因组序列比对以及简单重复序列的检测第40-41页系统发育分析第41-44页叶绿体基因组序列变异检测第44-45页结果与讨论第45-81页青刺果叶绿体基因组的结构第45-48页蔷薇科植物叶绿体基因组反向重复区的扩张与收缩第48-50页蔷薇科植物叶绿体在基因组水平上的序列变异第50-53页蔷薇科植物叶绿体基因组的简单重复序列第53-57页基于叶绿体全基因组的系统发育分析第57-61页叶绿体分子标记的鉴定第61-65页叶绿体基因组内由GC含量驱动的序列变异第65-80页叶绿体基因组的变异模式的机制探讨第80-81页本章小结第81-83页第三章植物线粒体基因组变异模式探讨第83-98页引言第83页研究背景第83-85页植物线粒体基因组中的水平基因转移第83-84页植物细胞核基因组研究概况第84-85页研究方法第85-86页基因组测序数据的选择和获取第85页水稻线粒体基因组的拼接和注释第85-86页水稻基因组大小估计、拼接和注释第86页研究结果第86-96页水稻线粒体基因组基础信息第86-89页水稻核基因组基础信息第89-91页水稻线粒体与核基因组之间的水平基因转移第91-92页新的植物线粒体基因组功能和变异模型第92-96页本章小结第96-98页第四章细胞器基因组完整解决方案第98-136页引言第98-99页研究背景第99-102页分析方法第102-118页结果与讨论第118-135页植物叶绿体全基因组组装结果第118-128页动植物全线粒体基因组组装结果第128-135页本章小结第135-136页第五章古老琥拍中DNA提取尝试第136-143页前言第136页背景介绍第136-139页实验方法与材料第139-140页实验材料第139-140页提取尝试第140页实验结果与讨论第140-142页琥珀中DNA提取尝试第140页提取方法改良与测序建议第140-142页本章小结第142-143页致谢第143-144页参考文献第144-167页博士期间发表论文目录第167-168页博士期间获得的奖励第168页。

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